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마크로젠의 분석을 의뢰하시는 고객님들이 자주하시는 질문에 대한 답변입니다. 페이지크기 10 30 50 [결과] 시퀀싱 관련 프로그램을 어디서 다운 받을 수 있나요? 마크로젠 공식 홈페이지로 접속하시면 관련 링크를 확인하실 수 있습니다. Finch Tv, Chromas, ABI 에서 제공하는 프로그램을 다운받으시면 ab1파일을 확인하실 수 있습니다. 여기 를 클릭해 주시면 관련페이지로 안내 됩니다. [BLAST] BLAST N,X의 차이점은 무엇입니까? Program Selection Guide 에 자세하게 설명 되어 있습니다. 참고 부탁드립니다. - BLASTN programs search nucleotide databases using a nucleotide query. - BLASTX search protein databases using a translated nucleotide query. [BLAST] BLAST 실패/성공은 무엇입니까? 고객님께서 의뢰하신 전체 시퀀스에서, 저희 마크로젠에서 보유한 vector database 와 random screening을 거친 후 붉은색으로 시퀀스를 표시해 드리고 있습니다. 붉은색 부분을 제외한 나머지 시퀀스를 가지고 BLAST하게 되는데, 그 부분의 시퀀스가 search하기에 충분하지 않으면, 실패로 분류되게 됩니다. [BLAST] 시퀀스에서 붉은색으로 표시된 부분은 벡터 시퀀스라고 하는데, 어떤 벡터와 저희 마크로젠에서 보유한 vector database 에 대해 random screening 되기 때문에 죄송하지만 어떤 vector와 일치하는지는 알 수 없습니다. [BLAST] BLAST 검색은 어디서 직접 할 수 있나요? http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 에서 가능합니다. [결과] Primer walking은 결과를 어떻게 주나요? Primer walking의 경우 최초 주문에 한하여 결과를 드리나, 전체 시퀀스의 진행이 완료되면 single contig 를 이메일로 전달해 드리고 있습니다. 따라서 진행이 궁금하시다면 전화/메일 주세요. [접수] 추가반응시 프라이머를 합성하려고 합니다. 두가지의 방법으로 주문 가능합니다. 1. oligo tab 에서 직접 주문 : 기타요구사항에 "시퀀싱팀으로 전달해 주세요." 라고 comment 해 주셔야 합니다. 2. 추가반응 시, 프라이머 입력정보에 type을 "제작" 으로 설정 후 시퀀스를 입력해 주시면 됩니다. [결과] 결과 상담전화 번호 ? 02-2113-7000으로 전화주시면 저희 마크로젠에서 진행되고 있는 전체 서비스 part를 연결 받으실 수 있습니다. (①시퀀싱 ②올리고 ③시약관련 ④NGS ⑤biochip ⑥GE mouse ⑦경영) 대전지사로 접수해 주시는 고객께서는 042)336-7080 로 문의 주십시오. [결과] ab1파일을 열어볼 수 있는 파일은 어디서 다운 받을 수 있나요? 저희 마크로젠 홈페이지 sequencing tab의 FinchTV, absequencer를 다운받으실 수 있습니다. [결과] 9시에 결과를 보내주신다고 했는데 결과가 늦어집니다. 50% 이상 실패한 주문에 대해서는 연구원들의 검토가 있은 후 결과발송이 이루어 집니다. 9시까지 결과를 받지 못하셨다면, 샘플의 전반적인 결과가 좋지 못하기 때문에 검토가 이루어지고 있는것 이므로 많은 양해 부탁드립니다. Sequencing 주문 시 사용하는 선납금으로 올리고 주문결제 가능한가요? 가능하십니다. 구체적인 상담은 2113-7041로 문의해주십시오. 동결 건조된 Oligo의 모양이 투명하지 않아요. 대부분의 Oligo는 투명한 비닐모양으로 마르지만 합성된 Oligo의 양이나 동결조건에 따라 하얀 눈꽃송이처럼 마르는 경우도 있습니다. 이 또한 정상적으로 잘 마른 경우이므로 안심하시고 사용하셔도 됩니다. 또한, 젤리처럼 마른 상태로 육안으로 보았을 때 덜 마른 것 처럼 보일 수도 있으나 출하 전 충분히 확인 후 보내드린 Oligo이므로 이 또한 사용하셔도 전혀 문제없습니다. PCR이 되지 않는데 Oligo의 문제가 아닐까요? PCR이 안 되는 경우는 대부분 Oligo의 문제보다는 다른 요인에 의한 경우가 많습니다. 먼저 실험상의 요인을 다시 한번 확인해보시고 Oligo의 문제가 의심될 경우에는 연락 주시면 해당 Oligo를 다시 수거하여 QC진행한 후 필요시 재합성해 드리겠습니다. 받은 Oligo에 대한 자세한 정보는 어떻게 알 수 있나요? (1) Oligo와 동봉된 sheet와 마크로젠의 Oligo주문 창에서 정보를 확인하실 수 있습니다. (dna.macrogen.com). (2)올리고 tube에 붙어있는 label에 기본적인 정보가 나와있으며 그 중 vol. for 100pmoles/㎕의 수치대로 녹이시면 100 pmole의 농도로 사용하실 수 있습니다. Oligo 사용법 및 보관방법 받으신 Oligo는 동결건조 상태이므로 사용하실 때 3차 DW 또는 TE buffer에 녹여 사용하시고 장기간 사용하실 Oligo는 여러 tube에 소분하여 -20도 이하에 냉동 보관하시기 바랍니다. Oligo의 QC는 어떤 방법으로 진행되나요? 마크로젠에서는 흡광도 측정과 분자량 측정의 두 가지 QC진행을 하고 있습니다. 우선 합성된 Oligo의 양이 충분한지 확인하기 위하여 Spectrophotometer를 이용해 흡광도 측정을 한 후, 통과된 Oligo는 MALDI-TOF 장비를 이용하여 정확한 분자량 측정을 합니다. MALDI –TOF방식은 최근 분자량 분석에 가장 정확한 방법으로 알려져있습니다. 따라서 기존의 gel을 이용한 QC방법에 비하여 N-1, N-2등이 포함된 Oligo를 더욱 정밀하게 분별해 낼 수 있습니다. * 마크로젠의 MALDI –TOF QC는 별도의 비용없이 모든 Oligo에 진행되고 있습니다. 정제방법에는 어떤 것들이 있나요? 마크로젠에서 실행하고 있는 정제는 MOPC정제법과 PAGE정제법이 있습니다. MOPC정제는 정제비용 추가 없이 진행됩니다. PAGE정제는 정제중 유실되는 양이 많기 때문에 0.2umole로 주문하셔야하며, 합성 후 3-4일정도 소요됩니다. Modified Oligo 가격 및 배송기간 (1) Modified Oligo의 가격 - (주문하는 Oligo의 mer수 * mer당 단가)+ Modified 가격 + 15000( PAGE정제비용) *구체적인 Modified Oligo의 가격은 [올리고 주문가격표]를 참고바랍니다. * Modified Oligo는 합성 되어지는 양이 많지 않고 PAGE정제를 반드시 진행해야 하므로 주문 시 scale단위를 0.2umole로 주문하시기 바랍니다. (2) 배송기간 - Modified Oligo는 매주 화요일에 합성 진행되며 대부분의 경우 금요일에 합성완료, 배송 진행됩니다. 60 mer 이상의 Long Oligo의 배송기간은 어떻게 되나요? Long Oligo는 합성시간만으로도 10시간 이상이 소요되므로 35mer이하의 Oligo를 주문하셨을 때보다 하루 정도 더 늦게 배송됩니다. 또한 long oligo는 합성효율성을 고려하여 80mer 이상의 합성에는 0.2 umole 농도로 주문하시는 것을 권장합니다. 일반 올리고의 배송기간은 얼마나 소요되나요? 당일 오후 4시까지 접수 완료된 35mer이하의 Oligo에 한하여 익일 오전 합성 완료됩니다. 서울지역은 익일 오전부터 배송 진행되며, 택배지역인 경우는 합성 완료된 다음날 수령하시게 됩니다.(택배지역은 주문조회 창에서 직접 배송조회 하실수있습니다,) 35mer 이상의 Oligo와 오후 4시부터 10시까지 접수 완료된 Oligo는 익일 오후 합성완료, 배송 진행됩니다. 새로운 BAC & Bacteria Whole Genome Sequencing 서비스란? 시퀀싱 분야의 신기종 454 Life Science 사의 “Genome Sequencer 20 System” 을 이용하여 BAC clone, Virus, Phage 및 bacteria의 whole genome sequencing 서비스입니다. 기존의 풍부한 시퀀싱 경험을 토대로 샘플 종류별로 세계적으로 가장 많은 분석 데이터를 도출하였으며, 세계 2번째로 “GS20”과 기존 “ABI 3730xl”의 데이터를 융합 어셈블 하여 최종데이터를 도출하는 시스템을 구축하였습니다. 앞으로 하시고자 하시는 연구에 있어서 최고의 파트너가 되어 드리겠습니다. * 실험소요시간 및 가격 실험 / 실험소요시간 / 가격 / 비고 BAC clone / 3 days / 문의 / 100kb 기준 Bacteria / 3 days / 문의 / 1Mb 기준 1. 실험소요시간은 주어진 샘플을 가지고 Library 제작에서 시퀀스 데이터 도출까지의 시간을 말하며, 고객님께는Bioinformatics 분석시간이 추가적으로 소요된 후 전달 됩니다. 2. Bioinfomatics 분석의 경우 Bacteria, Virus의 draft 시퀀싱은 Glimer3.0에 의한 유전자 예측, BLAST 분석, 어셈블리 기본정보 등이제공됩니다. 3. Single contig 요청시 draft sequencing 전용인 GS20으로 도출된 결과와, gap filling 작업을 위해서 기존 방법인 ABI 3730xl을 사용하여 도출된 데이터를 융합하여 기존보다 월등히 빠른 시간 내에 고객님이 원하시는 결과의 제공이 가능합니다. (샘플의 종류 및 상태에 따라 추가적인 분석소요시간과 비용이 소요될 수 있습니다.) 4. 미생물에서 이미 genome sequence가 나와있는 비슷한 종류의 샘플을 의뢰하시게 될 경우 보다 빠르게 비교하여 comparative genomics 관련 연구를 수행할 수 있습니다. 5. 샘플은 BAC, Cosmid, 정제된 Virus particle에서 추출된 DNA, Bacterial gDNA 에 한하며 이외의 샘플에 대해서는 별도로 문의해 주시기 바랍니다. 6. 샘플 준비 조건 – 가능하면 1㎕의 DNA를 2% agarose gel에 running 한 사진을 첨부해주시고, 샘플은 dry ice에 얼려져 있는 상태로 준비해 주시기 바랍니다. 1) Bacteria 의 경우 cell 상태로 주시거나, 직접 gDNA를 준비하여 주실 경우 약300ng/ul 의 농도로 약 10㎍ 준비해주시기 바랍니다. 2) BAC 의 경우 형질전환된 E.coli cell 상태로 준비해 주시거나, DNA 상태로 주실 경우에는 약100ng/ul 의 농도로 약 5㎍을 준비해주시되, exonuclease digestion을 수행하여 E.coli DNA를 제거해 주시기 바랍니다. [결과] 결과 그래프의 Phred Score란 무엇인가요? ■ Phred Base calling 프로그램으로 Sequencer가 만들어낸 이미지 파일(ABI, SCF, ESD등)을 읽어서 Fasta Format으로 변환하는 프로그램입니다. 그래프 이미지내의 Chromatogram의 곡선을 보고 적당한 Base를 지정함과 동시에 score까지 만들어서 파일로 만들고 FourierTransform Algorithm이 사용됩니다. Phred가 만들어내는 score를 QV (Quality Value)로 각 염기의 정확도를 판정할 수 있도록 quality value를 할당하며, quality value는 단순히 ‘phred score’라 부르기도 합니다. http://www.phrap.org QV = - 10 * log(P) ■ Phred score가 20인 염기의 에러 확률은 10¯² (정확도 99%) Phred score가 30인 염기의 에러 확률은 10 ¯³ (정확도 99.9%) Phred score가 40인 염기의 에러 확률은 10¯⁴(정확도 99.99%)입니다. [접수] 마크로젠에서 제공하는 Universal Primer는 어떤 것들이 있습니까? 마크로젠이 제공하는 Universail Primer 의 리스트 입니다. [접수] 추가반응이란 무엇인가요? 기존에 의뢰하였던 DNA와 새로운 Primer를 매치시켜 실험하는 방법을 뜻합니다. 추가반응의 경우 분석료가 새로 청구됩니다. [결과] 재반응을 의뢰할 경우 기간은 얼마나 소요되나요? 당일 오후 1시까지 접수되는 건에 한하여 익일 1번 실험을 진행합니다. 일반 sequencing과 마찬가지로 접수일로부터 24시간 이내에 결과를 받아보실 수 있습니다. 참고로 토요일은 재반응 실험을 진행하지 않습니다. [결과] 재반응이란 무엇인가요? 시퀀싱 실험 상에서 일어날 수 있는 machine error나 mis-handling 의 가능성에 대한 확인 작업으로, 같은 샘플과 같은 프라이머를 사용하는 반응에 대해 1회 무료로 제공됩니다. 따라서 같은 이름일지라도 새로운 batch의 샘플이 접수되거나 프라이머를 바꾸어 의뢰 된 재반응은 무료로 제공되지 않습니다. [접수] 토요일에도 택배 접수가 됩니까? 2006년 7월 1일부터 주 5일 근무로 인하여 토요일에 도착하는 샘플은 접수가 되지 않습니다. 금요일에 택배를 보내주셔도 월요일에 접수가 되오니 참고하세요.. [기타] DNA와 Primer는 보관됩니까? 의뢰일로부터 한달간 샘플을 보관해 드립니다. 제작 Primer일 경우는 6개월간 보관되며 그 사이 반송 요청이 없을 경우 폐기 조치 합니다. * 반송 요청시 택배비는 고객 부담입니다. [결과] 결과 데이터 보관 기간은 얼마나 되나요? 수주 완료일 기준 2010년 12월 1일 이후 부터의 모든 일반 시퀀싱 결과 파일 (ab1, scf, phd, seq) 파일은 영구적으로 보관되고 있습니다. 단, 시퀀싱 온라인 리포트 이미지 (chromatogram, quailty, pdf)는 3개월 이후 삭제됩니다. 3개월 이전의 data는 sequencing@macrogen.com 으로 메일 주시면 확인해 드리겠습니다. 아이디, 비밀번호가 정확한데 로그인이 안됩니다. 아이디와 비밀번호를 정확히 입력하였는데도 로그인이 되지 않는 경우는, 사용하시는 브라우저의 버전을 체크하고 설정을 아래와 같이 조정하시기 바랍니다. 1. 브라우저버전 체크 및 업그레이드 * 브라우저 상단의 도움말(H) -> Internet Explorer정보(A) 클릭 -> 버전 : 6.0.3790.0 을 확인 -> 버전이 6.0 이하일(5.5, 5.0, 4.0 등) 경우 http://v4.windowsupdate.microsoft.com/ko/default.asp 에서 Internet explorer 6.0 다운로드 후 설치 2. 즐겨찾기 혹은 개인 URL 이 아닌. 주소란에 http://dna.macrogen.com 을 입력하신 후 직접 로그인 해보세요. 즐겨찾기로 지정하여 방문하는 경우나, 특정 URL을 통해 마크로젠 시퀀싱서비스 홈페이지에 방문하는 경우 보안설정으로 인해 로그인이 안될 수 있습니다. 다른 홈페이지를 통해 마크로젠 시퀀싱서비스 홈페이지에 방문하시는 경우에도 그럴 수 있습니다. 그러니. 직접 주소 입력란에 http://dna.macrogen.com을 입력하신 후 방문해 보세요. 3. 브라우저 설정 브라우저 버전이 인터넷 익스플로러 버전 6.0 이상일 경우 쿠키 설정을 다음의 절차대로 수정해 주시기 바랍니다. 1) 인터넷 익스플로러 '도구' 메뉴에서 '인터넷 옵션' 선택 2) '쿠키 삭제'와 '파일 삭제(오프라인 파일 모두 삭제)'를 선택 3) '개인 정보' 탭에서 '고급 설정' 선택 4) '자동 쿠키 처리 덮어쓰기' 선택 및 '항상 세션에 쿠키 적용' 선택 5) 다시 '개인 정보' 탭에서 '편집' 선택 6) dna.macrogen.com 이라는 주소를 나타나는 빈칸에 입력 후 '허용' 선택 7) '확인'을 모두 누른 후 모든 인터넷 익스플로러 창 닫기 8) 새로운 창을 띄워서 로그인 시도 대량 Sequencing Service의 시간은 얼마나 걸리나요? 샘플의 수에 따라 다르지만 지놈사업부에서 하루에 처리할 수 있는 샘플 수는 12,960개로 국내 최대입니다. 하지만 여러 개의 프로젝트와 일반수주 샘플이 같이 수행되고 있으므로 영업부와 상의 후 가능시간을 통보해 드립니다. 대금 결제를 하고 싶은데 어떤 방법들이 있습니까? 결제를 하는 방법은 두 가지로 계좌입금과 카드결제가 있습니다. 영업부 결제 파트로 전화 주세요. (02-2113-7041) 계좌입금은 어떻게 하면 됩니까? 계좌입금은 저희 홈페이지에 안내되어 있는 은행들의 계좌번호로 입금을 하시면 됩니다. 단, 입금하실 때에는 가급적으로 담당 교수님이나 의뢰해주신 분의 성함으로 입금을 해주시면 되겠습니다. 과입금을 한 경우 환불 받을 수 있습니까? 당사로 전화 연락을 주시면 추가 의뢰하시는 것에서 차감할 수도 있으며, 원하시면 지정해주시는 계좌로 환불이 가능합니다. 카드결제는 어떻게 해야 합니까? 카드결제의 경우 연구비카드(LG, BC, 삼성)는 일정한 형식을 통한 전화승인이 가능하며, 그 이외의 카드는 영업사원의 방문을 통하여 카드단말기로 결제가 가능합니다. 단, 카드결제는 고객님의 보안상의 문제로 꼭 당사로 전화 연락을 주셔서 요청을 하셔야 가능합니다. 카드결제 후 카드 전표는 어떠한 방법으로 받을 수 있습니까? 방문결제 시 현장에서 직접 수령이 가능하며, 전화승인을 하시면 우편으로 카드전표를 받아보실 수 있습니다. 카드결제 취소는 어떻게 해야 합니까? 당사로 전화 연락을 주시면 일정한 형식을 통하여 승인 취소가 가능합니다. [접수] 샘플 발송은 반드시 지정된 택배회사를 이용해야 하나요? 아닙니다. 다른 택배회사를 이용하셔도 됩니다. 마크로젠에서는 고객의 편의를 위하여 업체(일양택배)를 지정하여 손쉽게 이용하실 수 있도록 제공하고 있습니다. 하지만, 편의에 따라 다른 업체를 이용하셔도 무방합니다. 택배 요금을 착불로 처리하실 때 5reaction 미만 의뢰할 경우 운송요금이 청구되오니 참고바랍니다. (서울:4,000원, 그외 지역:7,000원) [접수] 분석 의뢰 할 샘플은 어떻게, 어디로 보내야 하나요? 택배나 일반우편으로 발송하여 주시기 바랍니다. 택배의 경우 마크로젠에서 지정한 택배회사(일양택배 1588-0002)로 연락주시면 샘플포장은 물론 안전하게 운반해 드립니다. 특히, 5reaction 이상 부터는 마크로젠에서 운송비용을 부담하고 있사오니 적극 활용하시기 바랍니다. Library, cell stock 및 기타 특별 보관을 필요로 하는 경우 또는, 샘플 pick up 문의는 영업팀으로 연락 주십시오. (본사 : 우)153-781 서울시 금천구 가산동 60-24 월드메르디앙 벤처센터 1차 910호 시퀀싱팀) (대전지사 : 우)305-509 대전광역시 유성구 관평동 1359번지 한신에스메카 436호 시퀀싱팀) [접수] 염기서열분석 서비스를 의뢰하고자 하는데 어떻게 해야 하나요? 샘플이 준비되시면 마크로젠 홈페이지의 ‘온라인 시퀀싱 시스템’에 로그인 하시어 샘플 정보를 입력하신 후 주문번호와 함께 샘플을 발송해 주시면 됩니다. Full length Sequencing Service란 어떤 것인지요? 고객님께서 의뢰하신 Sample의 전체 염기서열을 분석하여 드리는 서비스입니다. Full length Sequencing Service는 Primer walking 또는 shotgun library를 제작하여 진행합니다. 위의 두 방법으로 얻어진 각각의 Sequencing 결과는 Assembly라는 과정을 통하여 하나로 이어진 염기서열 결과를 만들어 드립니다. Full length Sequencing Service시 두 가지 방법이 있는데 어떤 방법이 더 적절한가요 분석할 샘플 염기서열 길이에 따라 다릅니다. 1~10kb 크기의 샘플인 경우에는 Primer walking으로 진행하는 것이 용이합니다. 하지만 10kb이상의 샘플인 경우에는 shotgun library를 통해서 일을 진행하는 것이 용이합니다. Full length Sequencing Service의 경우 얼마의 시간이 걸리나요? 고객이 요청하신 샘플에 따라 다르겠지만 일반적인 경우 1달 정도면 95%이상의 결과를 얻으실 수 있습니다. 하지만 GC content가 높거나 Repeat sequence가 많은 경우에는 Gap filling에 추가적인 시간이 요구될 수 있습니다. cDNA library 제작 시 시간은 얼마나 걸리나요? Library제작에 소요되는 시간은 4주입니다. 이 기간에 cDNA library를 제작하고 Quality를 확인하여 결과를 발송하여 드립니다. [결과] 1000bp 이상 읽혀진 결과에서 BLAST 결과가 엉뚱한 gene으로 검색될 경우? 마크로젠에서 제공하는 정상적인 sequence는 보통 1000bp를 넘지 않습니다. 결과가 1200bp 까지 나온 것은 no signal로서 비정상적인 peak들 사이의 간격이 좁아져 1200bp까지 읽힌 것 처럼 보여지는 것이며 믿을 수 있는 data가 아니므로 Blast Search에 유용하지 않습니다. Data의 정확한 분석을 위해서는 electorphrograme이나 quality 값을 함께 참고하셔야 합니다. 아래 그림은 전형적인 no siganl의 양상입니다. [기타] 마크로젠 시퀀싱에 사용된 기기 및 프로토콜 정보는 ? Sequencing Kit : BigDye(R) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kits(Applied Biosystems) Sequencer : ABI PRISM 3730XL Analyzer (96 capillary type) PCR machine : DNA Engine Tetrad 2 Peltier Thermal Cycler (BIO-RAD) Sequencing protocol 시퀀싱 반응은 Applied Biosystems 사의 BigDye(R) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kits 을 이용하여 진행됩니다. BIO-RAD 사의 DNA Engine Tetrad 2 Peltier Thermal Cycler 를 사용하여 PCR 반응이 진행되며, 고객이 요청한 프라이머를 이용하여 sequence를 읽습니다. 반응이 끝나면 Applied Biosystems 사에서 Recommend하는 방법으로 반응에 참여하지 않은 dNTP와 반응물을 제거한 후, ABI 3730xl DNA Analyzer 에 loading 하여 시퀀싱 결과를 얻습니다 Sequencing reactions are performed in the DNA Engine Tetrad 2 Peltier Thermal Cycler (BIO-RAD) using the ABI BigDye(R) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit(Applied Biosystems), following the protocols supplied by the manufacturer. Single-pass sequencing is performed on each template using [universal or what you selected] primer. The fluorescent-labeled fragments are purified by the method that Applied Biosystems recommends as it removes the unincorporated terminators and dNTPs. The samples are injected to electrophoresis in an ABI 3730xl DNA Analyzer (Applied Biosystems). [접수] DNA는 어떻게 준비해서 보내야 합니까? Plasmid DNA (high copy number)는 100-150 ng/ul, PCR product는 25-50 ng/ul 정도의 농도로 가급적이면 1.5mL tube에 담아 각각 20ul씩 보내 주시기 바랍니다. 시료에 Salt, EDTA, protein, carbohydrate, RNA, EtOH, primer dimer 등이 남아 있으면 sequencing 반응 과정이나 capillary 안에서 inhibitor로 작용할 수 있으므로 purity 확보에 세심한 주의를 기울이셔야 합니다. 마크로젠은 DNA clean up 이나 농축 서비스를 하지 않으므로 user 가 의뢰 시 최적의 quality를 제공하여야 한번에 좋은 결과를 얻을 수 있습니다. Cosmid나 BAC DNA의 경우 더 많은 DNA가 반응에 필요하니 별도로 문의하여 주시기 바랍니다. [접수] Primer는 어떻게 준비해서 보내야 합니까? Custom primer 제공 시 시료와 분리된 용기(1.5mL tube)에 5 pmole/ul (5uM)로 20ul를 (5 reaction 미만일 경우) 보내주시고, reaction 수가 추가될 때마다 10pmole 씩 증가시켜 충분한 양을 보내주시기 바랍니다. Primer의 농도가 정확하지 않으면 reaction failure의 원인이 될 수 있으니 명확하게 표기하여 주시기 바랍니다. Sequencing 용 primer 는 PAGE나 HPLC 정제 이상의 grade를 권장하나 OPC 정제로도 비슷한 수준의 quality를 보장할 수 있다면 무방합니다. 17-25 mer , GC content 는 40-60% 정도로 하고 dimer formation 이나 hair-pin formation 이 4 bp이상 되지 않게 하며 end stability가 높게 디자인 합니다. 50℃(단일조건) 에서 annealing 하게 되므로 Tm은 55-60℃ 를 권장합니다. 마크로젠이 무료로 제공하는 primer는 아래 list와 같습니다. M13F와 M13R는 종류가 두 가지 이니 sequence를 필히 확인하시고 선택하시기 바랍니다. 아주 특이한 경우지만 몇 몇 vector의 경우 vector map에 해당 sequence가 존재함에도 불구하고 binding 되지 않는 경우가 있습니다. (예, PET, pCI, pENTR, pDONR 등) 마크로젠이 제공하는 Universail Primer 의 리스트 입니다. [기타] 염기서열분석 가격을 할인 받고 싶은데 어떻게 해야 하나요? 일반적으로 100reacton을 기준으로 하여 6,500원/reaction을 적용하여 할인을 해 드리고 있습니다만, 특별한 경우의 계약 (일정금액 이용에 대한 계약)에 한하여 특별가격을 적용하여 공급해 드리고 있습니다. 자세한 문의는 영업팀으로 연락주시기 바랍니다. (영업팀 : 02-2113-7041, sequencing@macrogen.com) [결과] 염기서열분석 기간은 얼마나 소요되나요? 일반적으로 정제된 DNA 상태로 분석의뢰를 하실 경우 마크로젠에 샘플이 도착한 후 24시간 이내에 결과를 받아 보실수 있습니다. 특히 ‘온라인 시퀀싱 시스템’ 을 이용하실 경우 실시간으로 분석현황을 보실 수 있으며, 보다 빠르게 분석 결과를 받아 보실 수 있습니다. 단, cell 또는 non-purified PCR product 및 기타서비스를 이용하실 경우 1~2일 정도 더 소요됩니다   1 2

마크로젠(본사) 서울시 금천구 가산동 60-24 월드메르디앙벤쳐센터(1차) 910호 153-781 전화문의 : 02)2113-7070 마크로젠(대전지사) 대전광역시 유성구 관평동 1359번지 한신에스메카 436호 전화문의 : 042)336-7080 본 사이트는 해상도 1024x768, Internet Explorer 6.0이상에서 이용하시기에 적합합니다. Copyright 2005-2011 (c) MACROGEN, LTD All Rights Reserved.